【5話収録】
■第6話「シロナガスクジラに逢った日」
　激しい嵐の翌日、ナナミたちは大西洋上で巨大なシロナガスクジラを見かける。そして偶然、そのクジラを追跡していた調査船スコーピオ号とも出会うのだった。スコーピオ号にはバハマで会った少年トーマスと彼の父親ルコント博士が乗っていた。ナナミたちはトーマスの案内で、スコーピオ号を見学する。しかしトーマスは海の暮らしになじめず、ナナミたちに故郷へ婦りたいと訴える。
■第7話「大西洋の底 トーマスひとりぼっち」
　アルにしかられて意地になったトーマスは、潜水艇スクイドボールを動かして彼を見返そうと考える。しかし海底地震の揺れでスクイドボールは海に転落。トーマスを乗せたまま、海底火山のふもと1千メートルの深さに沈んでしまう。誰も救助に向かえない深海から、トーマスは自力で脱出することになった。アルやナナミたちに励まされたトーマスはスクイドボールを操縦して、懸命に火山を登り始めるのだった。
■第8話「ザイール川の沈没船 秘宝の謎」
　新しい仲間にトーマスを加えたペペロンチーノ号は、アフリカのザイール川にやって来た。水中を調査していたアルとトーマスは、19世紀の沈没船と宝箱を発見するが、箱の中身は宝の地図が書かれた航海日誌と奇妙なメダルだけだった。アルは宝の秘密を調べようと近くの酒場を訪れ、ゲイルという男と知り合う。すっかり意気投合したふたりは、いっしょに宝探しをする約束を交わすのだが……。
■第9話「幻の地底湖に浮かぶ希望の船」
　ゲイルに宝の手がかりのメダルを奪われたアルは、仕方なくペペロンチーノ号へと戻る。すると今度は、アルと入れ違いにシェリルとトーマスが宝探しに出発していたのだ。シェリルたちは偶然ゲイルと合流し、宝の隠し場所を目指していた。心配してあとを追ってきたナナミたちも、どうにかゲイルたちの姿を捉えることができた。そしてザイール川上流の滝に到着した一行は、ついに秘密の洞窟を発見する。
■第10話「ペペロンチーノ号が陸を走る！」
　ナナミたちへの復讐を誓う、ギャングのメタルクロー一味。ペペロンチーノ号がザイール川上流にいると知った一味は、ボートで追いかけてきた。そこでナナミたちはトーマスのアイデアに従い、陸路でナイル川の源流へ逃げようとする。ペペロンチーノ号とティコを運ぶトラックは、見事にクロー一味を振りきった。しかしナイルの源流までは悪路が続き、ナナミたちには予想外の困難が待っていた。

製作年度：1994

第6話　脚本：青山紀之／演出：稲垣卓也／絵コンテ：辻 伸一／作画監督：井上 鋭
第7話　脚本：青山紀之／演出：花井信也／絵コンテ：辻 伸一／作画監督：五月女浩一朗
第8話　脚本：三井秀樹／演出：稲垣卓也／絵コンテ：知吹愛弓／作画監督：大城 勝
第9話　脚本：松井亜弥／演出・絵コンテ：楠葉宏三／作画監督：佐藤好春
第10話　脚本：三井秀樹／演出：楠葉宏三／絵コンテ：高木 淳・楠葉宏三／作画監督：井上 鋭

原案：広尾 明／製作：本橋浩一／企画：佐藤昭司・清水賢治／製作管理：本橋寿一／音楽：美和 響／キャラクターデザイン：森川聡子／美術設定：伊藤主計／美術監督：森元 茂／プロデューサー：余語昭夫・鈴木吉弘／監督：高木 淳／制作：日本アニメーション・フジテレビ

ナナミ：林原めぐみ／スコット：池田秀一／アル：緒方賢一／シェリル：水谷優子／ジェームス：増岡 弘／トーマス：松井摩味／ルコント：納谷六朗／ゴロワ：山下啓介／ゲイル：石丸博也／メタルクロー：郷里大輔